A ver si entendí:
Vos querés grabar temas que tenés en mp3 en audio "normal", esto sería a .cda, lo hacés grabando CD de Audio con el Nero, para escucharlos en un equipo normal y corriente. Hasta ahí todo bien.
Ahora, lo de borrar los temas, si a lo que te referís a borrarlos del CD donde los grabaste (regrabable), si, los borrás como si tuvieras cualquier tipo de archivo.
Abrís el Nero, Grabador, Borrar disco de reescritura y listo
Como ayuda extra: Grabá los temas a baja velocidad (no más de 4x), de lo contrario a veces no se oye bien, y tampoco te olvides que no todos los equipos de audio son compatibles con discos regrabales

Saludos, contá si ero eso lo que buscabas