Pasando el NOD 32, me salta el virus Win32/CMDOW 143
que se encuentra en C:\Windows\System32\CMDOW.exe
lei por algun lado que esto puede ser una falsa alerta... pero no tengo idea..
es virus o no??

Sip, es una falsa alerta, esa aplicación sirve para ocultar ventanas durante la ejecución de procesos batch.
Varios programas lo detectan como positivo.

Seguramente usas una versión desatendida de windows, y ese comando se coloca para que se oculten las ventanas mientras se realiza el proceso de instalación.

Saludos