Me auto-respondo. La solucion a este problema es muy sencilla:
Hay que ir a Inicio>Ejecutar>sfc /scannow. Luego nos aparecera una ventanita pidiendonos que introduzcamos el cd original de windows. Lo hacemos y le dejamos que trabaje. Cuando acabe la ventana se cerrara. Despues de eso reiniciamos el equipo ( acordaos de sacar el cd de windows para que no se os inicie desde el cd ) y ya esta.
Una vez hecho eso yo recomiendo que paseis un antivirus como el panda Active Scan:
http://www.pandasecurity.com/activescan/index/?track=1&Lang=es-ES&IdPais=62
y luego que paseis un antispyware como el Superantispyware o el Ad-Ware 2008 ( ambos los podeis encontrar en este foro )
Espero que si alguien mas tiene este problema que le haya servido mi solucion.
Por mi parte el tema esta solucionado, admin!