En tu plca base se sigue el standar de Intel luego no tendrás problemas para conectar tus usb frontales.

En tus cables del gabinete los colores representan lo siguiente: los dos cables rojos son del Power (5V) son los que alimentan el puerto, los cables verdes son los cables de datos positivos (data +), los blancos son los data -, y los negros son los GND (masa)

Fijate en este croquis:



Verás que el conector de la placa tiene 9 pines (croquis de la izquierda) marcados desde el pin 1 al 9 (el 9 no tiene pin y el 10 que ves se usa para otros estandares), los cuales sirven para conectar dos puertos usb, usan los pines 1,3,5,7 para un puerto y los pares 2,4,6,8 para el otro, de los cuatro pines de cada dispositivo dos son para datos (DATA -, DATA +, uno para voltaje de 5 v con el cual se alimenta el puerto y uno de MASA (Tierra).
Donde no te puedes equivocar es en conectar el de tensión 5 V en un pin que corresponde a datos ya que entonces te cargarás el puerto..

Te pongo un ejemplo y básate en el para conectar los tuyos con el croquis de tu placa base y las marcaciones de los cablecitos:

PORT +
PORT -
GND 1º-------7 (Gnd) Negro
GND 2º-------8 (Gnd) Negro
VCC 1º-------1 (power1) Rojo
VCC 2º-------2 (power2) Rojo
DATA- 1º-----3 (dx -)) Blanco
DATA- 2º-----4 (dy -)) Blanco
DATA+ 1º-----5 (dx +) Verde
DATA+ 2º-----6 (dy +) Verde

Un puerto estaría conectado a los pines 2, 4, 6 y 8
y el otro puerto a los 1,3,5 y 7




Saludos