Hola,

El tea timer del Spyboot es una de sus principales caracteristicas, y que lo distingue de los demas antispyware gratuitos, no deberias desactivarla, lo de los cambio de archivos es por que obviamnte se van a modificar los archivos, pero si tu sabes la causa de las modificasiones entonces permitelas y ya.

Saludos y si no hay mas dudas damos por solucionado el tema