Lo has desinstalado, limpiar sus carpetas y vuelto a instalar..¿
Antes del problema no has instalado algun complemento wue pudiese generar la situación.¿

Realiza lo siguiente, entra en firefox modo seguro, esto desabilitara cualquier complemento que tengas momentaneamente.

Inicio->todos los programas->mozila Firefox->Firefox "modo Seguro"

Usa el firefox de esa manera y verifica si encripta o no las contraseñas.

Nos comentas a la vuelta