Prueba a hacerle una comprobación del disco duro o escandisc en "Herramientas del sistema"

Prueba también con HDD regenerator (es un programa de pago). Como te dije más arriba yo no me fiaría mucho de la información que metas en ese disco duro.

Comprueba el cable IDE donde tienes el disco o discos duros y prueba con otro nuevo (de 80 hilos) y el molex de alimentación (cambialo por otro y prueba)

Comprueba si en cada formateo o escandisk el disco va perdiendo capacidad, esto quiere decir que tiene muchos sectores defectuosos