Me imagino que es como tu dices, mientras el pc no detecte las unidades ni el flash desinfector ni el scanonline las veran para realizar su trabajo, pero tiene que ser problemas de las unidades, ya que es casi imposible de que todos los puertos usb esten dañados como para no reconocer dispositivo alguno.

Quiero que prubes lo siguiente descarga un live cd de ubuntu, lo grabas como imagen en un cd y configuras la bios para que bootee desde la unidad de cd-room, luego entras a ubuntu y conectas tus dispositivos y verifica que los reconosca..