Que tal rinita_inverse,

1.-Si ya no tienes infeccion puedes reparar tu sistema operativo, con la opccion de reparar no se pierden archivos ni programas, solo las actualizaciones realizadas hasta dicho momento. Manual de Instalación y reparación de Windows 2000/XP/2003

2.-Si no te sirve, para rescatar tu informacion descarga un live cd de ubuntu lo grabas como imagen y configuras la bios para bootear desde la unidad de cd-room, desde el puedes acceder al windows sin problema y con tu pendrive guardas lo que nesecites

3.-Colcar tu disco duro como slave en otro Pc y rescatar tus archivos importante..