tenias claves de usuario antes de reinstalar ? al reintalar debistes elegir instalar en la misma carpeta asi cualquier archivo infectado del sistema se sobreescriría y no hubiese problemas, salvo tus documentos con infeccion..

Para recuperar tus documentos puedes probar acceder con un Live Cd de Ubuntu (siempre y cuando tu disco duro este fisicamete bien) con el cual booteas desde la unidad de Cd-room y entras al windows y la antigua carpeta....

Suerte........