Al parecer eso no es de spyware, virus o lo que sea.
Siento que es el disco duro, porque dices que hace un ruido. Hace unos dias vi una PC que nunca se apagaba!!! el disco duro ya estaba quemado.
Como mencionan pasa tu antivirus, tu antispyware, Ccleaner, y haz una desfragmentacion y un CHKDSK, si tu compu aun esta lenta, ve viendo modelos de discos duros.