Hola SeteSete, bueno depende del sistema que tengas y como lo tengas configurado es lo que consume cualquier programa de limpieza.

Por eso siempre es recomendado que si le vas a pasar un Antivirus, Antispyware o similar, que cierres todos los programas y lo dejes trabajar a este solo hasta que termine.

Parece que ya lo otro es problemas de configuración del sistema, aunque igual para confirmar que ya no hay nada en tu sistema pásale "Spy Sweeper" actualizado nuevamente y hacele un escaneo online con "Kaspersky Antivirus."

Salu2