Hola

Bueno, hace mucho que no uso ese programa, sin embargo, te diría que revises que has desactivado la creación de todos los logs, es decir, puede que hayas desactivado los logs de aplicaciones y no el de hosts, o algo así.

Otros programas funcionan de esa manera.

Si no es esto, podrías crearte un sencillo programita o archivo .bat que elimine esos logs cada vez que inicias la computadora.

Felicidad