Hola,
Bueno, no es el primer caso que veo de este tipo, de hecho me pasó al querer instalar Quick Time Alternative, una alternativa más liviana que el Quick Time oficial.
Ese que tu has bajado está bien, solo que las nuevas versiones se llaman ItunesSetup, porque Apple ha unido el Quick Time con el Software para los Ipod.

Haz lo siguiente, ve a Panel de Control y desde Agregar/Quitar Programas desinstalas el Quick Time, luego Baja estos programas, CCleaner y RegSeeker, con el primero, limpias temporales y restos de archivos, y con el segundo, limpias el registro de windows. Aquí tienes el manual de RegSeeker.
Luego de esto, reinicia e instala nuevamente el Quick Time.

Si no funciona, vemos al Quick Time Alternative.

Me cuentas.

Saludos