Si Windows no arranca intenta reparar el sector de arranque, para ello debes seguir estos pasos:

- Inicia la máquina con el CD de instalación de Windows y una vez que cargue todos los archivos necesarios te encontrarás con una pantalla donde te da una opción para Reparar el Sistema y presionas la letra R

- Luego te encontrarás con otra opción que te dirá algo así como utilizar la consola de recuperación, elige esa opción y presiona la tecla Enter.

- Una vez en la consola de recuperación te pedirá el número de partición que deseas reparar (por defecto el 1) y luego la contraseña del administrador (sino pusiste contraseña presiona Enter)

- Una vez en el prompt C:\ escribes el comando fixboot y luego presionas la letra "s" para aceptar.

- Escribes el comando exit para salir de la consola y verifica si el error persiste.

- Si el error persiste repite el mismo procedimiento pero ahora en vez de escribir fixboot escribe chkdsk /r para reparar el volumen del disco.

De ahí nos cuentas como te fue.

Saludos