Hola!!!
Pues efectivamente, una vez hechas las reparaciones debes deshacer los cambios que te pedí, es decir debes volver a acultar los archivos y volver a activar la restauración del sistema, siguiendo los mismos pasos pero a la inversa.
En cuanto a las entradas que debes eliminar con RegSeeker, pues sencillamente todas, ya que son entradas desacativadas, invalidas..etc. Es más debes pasarlo varias veces hasta que no te detecte nada. Asegurate de todos modos que tienes marcada la opción "Backup antes de suprimir", esto nos permitirá recuperar una entrada si es eliminada por error del programa, aunque eso es muy poco probable.
Sobre tu problema con la barra del explorador, pues no se a que se debe, sigue los 11 pasos de este
tutorial por si se le pasó algo al HijackThis y después nos pones tu nuevo log.
Saludos