Hola!!!
Pues que yo vea, solo te falta por sacar esto:
R1 - HKCU\Software\Microsoft\Internet Explorer\SearchURL,(Default) = +
Reinicia a prueba de fallos y luego le das fix con HijackThis.
En cuanto a tu pregunta de si es mejor tener 2 o 3 particiones, pues ahora mismo no te sabría decir. Te sugiero que plantees esa pregunta en el subforo de "Ayuda General" y dejemos este mensaje unicamente para resolver tu problema principal.
Bueno, ya nos contarás.
Saludos