te recomendaria que probaras a desintalar esa version y regresarte a la version 0.46c ya que es la estable y la que tu tienes aun esta en su fase alfa lo cual siempre causa casi siempre problemas hasta a los usuarios mas expertos en emule, igual tendras que dejar pasar tambien la version beta (0.47b) espera hasta que salga la letra "c".

acabo de ir a google y puse "low id emule" y salen bastantes manuales y todos muy distintos sobre como tratar este problema, ve con calma y ve cual te sirve.